许多自然流产与染色体异常有关，有很多女性怀孕会以自然流产结束。其中，大多数胚胎在着床后很快就会停止发育，仅表现出月经过多或月经推迟，即生化妊娠。也就是说，很多患者已成功孕育，并且不幸中止，但患者不知道。
80%的流产发生在12周内，之后流产率逐渐降低。至少有一半以上的早期流产是由胚胎染色体异常引起的。换句话说，健康父母的胚胎也可能会有染色体异常现象，并且可能导致流产，并且比例还很大。
为什么父母健康还会有胚胎染色体异常?
这是因为在人类生殖过程中，为了保持子代与上一代染色体的数目一致，染色体在复制过程中会经历两次减数分裂，这个过程中就可能会出现如染色体缺失、染色体倒位、重置等现象。
大多数染色体异常的胚胎将在移植后发生流产和胎停的现象，很少能够成功出生，就算出生也会有先天智力发育迟滞和生长缓慢。
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